Zur Zeit existieren vier Standorte, an denen das Universitätsklinikum Bonn seine Kliniken betreibt.
Der größte Teil der Kliniken befindet sich auf dem Gelände im Bonner Stadtteil Bonn-Venusberg (südwestlich der Bonner Innenstadt im Naturschutzgebiet Kottenforst gelegen).

Drei andere Kliniken haben ihren Standort im zentralen Bonner Stadtgebiet. Dies sind die:

Zentrum für Kinderheilkunde Universitätsklinikum Bonn (AöR) Adenauerallee 119 D-53113 Bonn	Medizinische Klinik und Poliklink III Hämatologie und Onkologie Universitätsklinikum Bonn (AöR) Wilhelmstraße 35 - 37 D-53111 Bonn	Zentrum für Zahn-, Mund,- und Kieferheilkunde Universitätsklinikum Bonn (AöR) Welschnonnenstraße 17 D-53111 Bonn